2006 Aralık ayında Dışişleri Bakanlığında göreve başlayan Cafer Olcay Karakaş, merkez görevlerinde Vize ve Irak Dairelerinde çalışmıştır. Karakaş dış tayinlerinde ise Bangladeş, Finlandiya, Tacikistan ve Ürdün'de görev yapmıştır.